在努尔哈赤建立后金后，清朝逐渐崛起，远在新疆的各部落首领，如固始汗，纷纷派遣使者归顺后金。固始汗在向青藏发展过程中，将部落盟主的职位交给了侄子鄂齐尔图汗。

到了康熙即位的十多年后，新疆的准噶尔部落首领噶尔丹，凭借着强大的军事力量，击败了鄂齐尔图汗，并废除了各部落间松散的联盟，开始以武力统治整个新疆，最终建立了准噶尔汗国。

随着实力的不断增强，噶尔丹逐步吞并周围的部落，尤其是土尔扈特部，这个部族被迫迁徙到伏尔加河下游，保留了自己的族群。然而，噶尔丹日益显现出割据一方的野心，这时的沙俄也正处于扩张的高峰期，它试图通过拉拢噶尔丹，利用他的力量与清朝对抗，进而获得更多的领土。

沙俄支持噶尔丹攻打外蒙古，外蒙古的首领在噶尔丹的进攻下节节败退，最终不得不请求清朝出兵支援。康熙帝在应对外蒙古的请求时，既安排了避难之地，又斥责噶尔丹停止侵略。然而，噶尔丹不听命令，继续进攻，甚至南下逼近清朝边境。康熙决定亲自出征，派遣东、西两路军马进行反击。

最终，康熙亲自率军前往，与噶尔丹展开激战。右路军在与噶尔丹交手时暂时撤退，但在乌兰布通展开激烈抵抗。康熙采用火炮攻破噶尔丹的“驼城”，并通过步兵和骑兵夹击，成功迫使噶尔丹逃入山区。噶尔丹随后求和，康熙最终决定放他一马，让他带着残部撤退。

然而，噶尔丹在返回后又得到沙俄的支持，再次发起对外蒙古的进攻。康熙这次决心彻底消灭噶尔丹，准备了大量物资和兵力，诱使噶尔丹深入。噶尔丹宣称自己得到了沙俄的六万兵力支持，并自带三万铁骑。而康熙则集结了九万大军，分为三路：东路由黑龙江将军率领，西路由抚远大将军费扬古指挥，中路则由康熙亲自带领。

在这场战斗中，费扬古成功偷袭了噶尔丹的补给线，并击杀了噶尔丹的妻子。噶尔丹和他的部下只有十几人逃脱。噶尔丹的后方也被策妄阿拉布坦占领，康熙再度要求噶尔丹投降，但他由于沙俄的支持拒绝投降。最终，康熙亲自再次出征，经过一番激战，噶尔丹由于失去支持，最终在众叛亲离之下自杀。

噶尔丹死后，沙俄重新支持策妄阿拉布坦，他带兵进攻西藏，准备进一步扩张。然而，康熙及时派兵击败了策妄的军队。康熙去世后，策妄继续在西藏活动，直到雍正五年去世。策妄的儿子噶尔丹策零继位，并再次获得沙俄支持，企图继续割据。但在和通泊之战中，清军遭遇重大败北，清朝一度处于困境。

然而，策零最终被清军设伏打败，元气大伤，失去了继续作战的能力。到了乾隆初年，双方达成和解，十年后，策零去世。准噶尔内部为继承汗位爆发内乱，部分部落选择投降清朝，而剩余的势力最终被乾隆平定。到了乾隆二十二年，清军最终胜利。

这场与准噶尔的战斗，实质上也是清朝与沙俄的较量，沙俄一直在背后支持准噶尔，企图借准噶尔的力量侵占清朝的西北疆土。最终，清朝的胜利不仅捍卫了西北边疆的稳定，也加深了各族人民的融合与团结。

然而，这场战争的胜利并非没有代价。乾隆帝下令铲除准噶尔部族，大部分准噶尔人因此灭绝，留下的部族几乎无存，这也是许多人对这场战争结果提出争议的原因。