作为皇帝来说，顺治的存在感确实比较低，但他在后宫里却不肯消停。孝庄虽然给儿子精挑细选的是娘家那头的博尔济吉特氏，但皇帝只和她过了两年的夫妻生活，就找借口把她给废掉了。其实皇帝此举，未免没有嫌母后干涉太宽的意思。但在孝庄看来，为了壮大娘家的势力，她还得继续这样做。

如此一来，她给顺治再找的第二仕皇后，自然也是自己娘家那头的，反正她的家族是那样的庞大，从不缺少如花似玉的姑娘。如此一来第二个博尔济吉特氏也就是阿拉坦琪琪格，就这样进了宫里。起先进宫的时候，皇帝把她封为了妃子，只过了一个月就在母亲的压力下，让她当上了皇后。

虽然从皇后本人来说，明显汲取了前任皇后的教训，并没有对皇帝本人作出太多的干涉，但皇帝本人还是不满足，因为这时他已经喜欢上了一个叫做董鄂妃的女子。尽管皇帝想要故伎重施，但这次孝庄却不肯答应了：皇后又没有犯什么错，凭什么要被你废掉？

虽然顺治和皇后的关系很是微妙，或者说是尴尬，但事实上也没有持续太久的时间，因为顺治没过几年就驾崩了，这时候皇后虽然才22岁，却因为儿子康熙当上皇帝的缘故，也成为了后宫里的太后。其实康熙之所以与她感情这么深厚，与她长期的抚养照料有着直接的关系。

虽然康熙的生母不是她，但在康熙当上皇帝的第二个年头，他的生母就因病离开了人世。那时候的康熙，连自己的生活都不能自理，更不要说临朝亲政了。正是在他孤立无援的时候，已经成为太后的阿拉坦琪琪格，接过了照料皇帝的重任。正因为两个人之间有这么一段特殊的关系，为此康熙对她也如同亲生母亲那样，可以说是相当的孝顺。

等她到70岁的时候，康熙皇帝就特意为她举行盛大的祝寿宴会。这时的皇帝已经是57岁的小老头了，居然兴奋的不能自已，在微醺的状态下，主动跑到舞台中央，为养母载歌载舞，以此来表达自己的祝福之情。在他之前，还没有哪个皇帝有过这样出格的举动，可见母子情深。

此时已经是仁宪皇太后的她，虽然很感激皇帝为自己所做的一切，但还是觉得这样不好。一来有损皇帝的形象，二来皇帝也不小了，因此她认为有这番心意就足够了。然而皇帝却执意不肯，认认真真地跳完了这场舞。其实皇帝对她的好，并不只是在这些方面，在太后快要离世的时候，当时康熙的身体也是每况愈下，还坚持去向太后请安问好。在尔虞我诈的后宫里，她能够拥有这么一段真挚的感情，真的是相当难得。

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