1625年,后金大汗努尔哈赤(清太祖)决定将都城从辽阳迁移到沈阳,这一举动使沈阳成为了后金的都城,标志着东北的政治、经济和军事中心从辽阳转移到了沈阳。到了1634年,后金的第二任领导人皇太极(清太宗)将沈阳改名为盛京,并于两年后的1636年正式称帝,改国号为大清,即满清(大清王朝、大清帝国)。随后,皇太极开始积极扩展其势力,计划征服中原。崇祯十七年(1644年),在中原动荡的时机下,满清摄政王多尔衮借助汉人降将吴三桂的帮助,带领满蒙汉八旗军主力突破山海关,并在山海关打败了李自成,顺利摧毁了大顺政权,成功占领了北京,进入中原。没过多久,多尔衮将顺治皇帝、孝庄太后以及大清的政府机构从盛京迁往了北京,加之他带走了10余万清军主力,盛京几乎变成了一个空城。顺治三年(1646年),顺治皇帝发布诏令,将盛京降格为留都,并任命一名内大臣驻守此地。
考虑到盛京在战略上的重要位置及其作为龙兴之地(即东北)的独特意义,康熙四年(1665年),康熙皇帝在盛京设立了镇守奉天等处将军一职,也就是奉天将军。到了乾隆十二年(1747年),这一职务被改为镇守盛京等处将军,即盛京将军,并成为了一项固定职务。当时的盛京仍然保留了六部(吏部、户部、礼部、兵部、刑部、工部),几乎像一个独立王国。盛京将军的职权下辖盛京副都统、锦州副都统、熊岳副都统、金州副都统、兴京副都统以及一名总管,这些副都统分别驻守在关外的各个战略要地。盛京的辖区大致覆盖了现在的辽宁地区,满蒙汉八旗军及其家属总数接近10万人,全部由盛京将军管理,驻军规模仅次于北京。 除此之外,盛京将军还负责管理吉林将军和黑龙江将军,这也使其成为了大清帝国的龙兴之地的守护者。在两次雅克萨之战中,盛京将军多次组织来自盛京、吉林、黑龙江等地的清军前往支援前线。当时,由于清廷内心对汉人的防范,实行了山海关沿线的封禁政策(柳条边墙),禁止关内的汉人迁移到东北地区开垦。这项政策的实施,由盛京将军负责,因此,盛京将军自然也被视为满清龙兴之地的守门员。然而,第二次鸦片战争后,沙俄通过兵不血刃的方式占领了外东北60余万平方公里的肥沃土地,这一事件警醒了清廷,随后他们逐步放开了关内汉人迁移到东北的限制。随着大量汉人移民的涌入,人口优势逐渐弥补了沙俄的军事优势,最终确保了东北地区留在了中国的版图内。1904年至1905年,沙俄帝国与日本帝国在大清帝国的龙兴之地——东北——爆发了日俄战争。这场战争暴露了大清帝国的虚弱和无能,加速了清廷的灭亡。在战争期间,清廷认识到日俄两国对东北地区的侵略意图,随即采取了一些补救措施,其中最重要的一项便是废除了关外的将军管辖体系(盛京将军、吉林将军、黑龙江将军),效仿内地制度,开始设立行省,即设立奉天(辽宁)、吉林、黑龙江三省,每个省设有巡抚,三省的上方设立了东三省总督。光绪三十三年(1907年),清廷正式下诏撤销盛京将军衙门,从此盛京将军成为历史名词。