迄今为止，日本一直流传着一种颇具争议的传闻：有人认同中国史学界的观点，认为天皇是中国人的后裔。故事要从秦始皇时期说起，那时有一位名叫徐福的方士，奉命东渡日本。他带去了三千名童男童女，还带来了中原先进的耕作技术、稻米种子，以及丰富的文化技艺，更有众多技艺精湛的工匠，被称为“百工”。这样一来，日本不仅有人口延续，后代的教育和就业问题也顺理成章地得以解决。秦始皇的用心可谓深远，但他当时的核心目的其实是寻求长生不老之药。

正因如此，日本对徐福极为尊敬，尊称他为“司农神”，有时也称其为“司医神”。甚至日本首相都曾宣称自己是徐福的后代。徐福的墓地在日本得以妥善保存，不仅如此，当地还保留着专门的祭奠节日，以此表达对徐福的崇敬与认同。这种情感上的认同，折射出日本人对自身历史根源的深层认知。

然而，依据日本史学界最新的研究资料，日本人的来源可能更为复杂，部分可能源自亚洲游牧民族。考古学为这一观点提供了线索：天皇的陪葬品中，以镜、刀为主，后来又出现金饰、玉饰、马具等，这些都是中国贵族常用的物件。天皇选择殉葬品极讲究身份象征，不会随意放置非阶层的物品。因此，有学者推测，自五世纪起，天皇可能出自一个迁徙而来的新家族，这个家族的成员可能是东征而来的民族。

考古发现进一步表明，日本由东亚迁徙的游牧民族融合而成。这些游牧民族剽悍异常，当时来自中国的首领与朝鲜部落大王在斗争中脱颖而出，最终统一了各部族，形成了日本的第一个天皇。换言之，日本天皇的血统可能既有中国，也有朝鲜的成分。日本第一任天皇神武天皇，有人甚至推测他就是徐福本人。考古学指出，日本天皇制度与中国有诸多相似之处，包括生活习惯、信仰，甚至相貌特征，这都支持天皇祖先可能源自中国的可能性。

民间对《史记》的记载深信不疑，认为日本人正是徐福率领的童男童女后裔，他们随大秦帝国东渡日本，一去不返。基因学的分析显示，日本并非单一民族，而是混血后裔，祖先包括绳纹人和弥生人。弥生人带有东南亚的特征，同时也接近东北亚人群，如朝鲜人和满族人。

在弥生时期，日本出现过一支“骑马民族”，属游牧性质。进入大和时代后，移民潮逐渐平息。经过多次复杂混血，日本人逐渐接近汉朝中原人的遗传特征，这是否仅仅是偶然？或许并非如此。

日本还流传着一段徐福与名叫千布的女孩的爱情故事，甚至有人自称是徐福的后代。日本虽然历史上藐视中国，但在中国强盛的时代，却心生敬畏。日本人相信，两宋之后中国衰落，他们才敢更显自信。更有趣的是，他们坚信徐福曾修建日本长城，这是秦长城的缩小版，用于防范秦始皇的追索。在江户时代，日本曾动员大量人力建造这道防线。

徐福登陆的地点与神武天皇登陆地点一致，天皇墓中出土了铜镜和战刀等秦朝遗物。考虑到当时日本仍使用石器，这些高端物件无法由本土制造，因此，徐福就是神武天皇的推测并非空穴来风。 日本人自认民族优越，认为拥有世界上最优质的基因，其中甚至包括秦朝基因。令人惊讶的是，日本古代历史的记载几乎全部使用汉语书写。

另一方面，也有说法认为天皇血统与朝鲜有关。日本考古学家对古代人DNA分析显示，日本人更接近朝鲜人而非冲绳人。明仁天皇曾提到，其祖先女性中有古朝鲜血统，但这一说法在日本国内常被政治化，用作侵略朝鲜的口实，可信度有限。 关于日本祖先，还有阿依努人的说法。阿依努人最早居住于北海道，肤色偏黑，与欧洲人有些相似，也与爱斯基摩人有点像。他们在六七千年前由通古斯族迁徙至日本，长期被日本其他民族歧视，不被承认为祖先。倭人自认优越，但在那时只是“北漂”，三千年前的绳纹时代已有水稻技术，而阿依努人仍以狩猎为生。 大和民族的祖先与阿依努人同属新绳纹人，但日本民众拒绝接受这一结论，坚持认为自己的祖先必然源自“优质民族”。旧石器时代向新石器时代过渡时，阿依努人移民至北海道，而天皇则并非阿依努人，也非倭人，极有可能来自中国。 关于日本天皇的起源推测，中国、朝鲜与亚洲游牧民族都是热门讨论话题。然而根据皇家记录，天皇的来源往往被描绘得神秘莫测，如同神仙所生。天皇血统问题一直是日本社会高度关注的议题，而对秦朝来源的争议，也折射出日本对中华古文化的崇拜与认同。