1928年3月24日，南京国术研究馆正式成立，馆长由原冯玉祥西北军的二号人物张之江担任。这一决定让许多人感到疑惑，因为张之江作为西北军的核心人物，为什么要放弃手中的权力，去担任这样一个新成立的国术馆馆长？

原因在于当时冯玉祥短暂“下野”后重新掌握西北军大权，而张之江则在冯玉祥离开时暂时代理西北军的领导工作。冯玉祥复职后，张之江感到自己在西北军中的位置变得尴尬，因此选择了退出军界，转而到南京担任了军事委员会的一个闲职。尽管如此，张之江的心里并不安分，他在南京并未完全放下手头的事务。于是，他与戴季陶、吴稚晖一起，前去找蒋介石请求财政支持。没想到，蒋介石竟然批准了资金，使得南京国术馆从一开始便成为了一个“半官方”组织。

南京国术馆的排面可不小，冯玉祥担任理事长，张之江是馆长，而副馆长则是军阀李景林，这一系列重要人物的参与让国术馆看上去声势浩大。尽管如此，冯玉祥对于这个国术馆并没有表现出任何兴趣，甚至有些轻视他所参与的这个项目。他曾表示，这不过是张之江“退休”后找点事做，带着一群“武林高手”玩玩而已。冯玉祥为什么如此看不上传统武术，至今没有确切的解释。

尽管冯玉祥心不在焉，张之江依然广泛邀请各路武术高手加盟南京国术馆。因为孙禄堂在武术界的名气，南京国术馆决定聘请他担任教务主任兼武当派门长。孙禄堂也答应了邀请，随后他从北京启程，经过天津、上海后，于1928年4月下旬到达南京。然而，让人意外的是，孙禄堂仅在南京国术馆待了不到五天，便决定辞去职务，离开南京，转而接受江苏镇江国术馆的邀请。

那么，为什么孙禄堂在短短的五天内就离开了南京国术馆呢？根据孙禄堂的女儿孙剑云的回忆，主要是由于孙禄堂与张之江在理念上的严重不合。在一次欢迎宴会上，张之江对孙禄堂说：“大家都知道老先生是万能手，我不敢让您留下千手万手，每期留下个百八十手就行了。”对此，孙禄堂回应道：“一年下来，能学会三手就不错。”张之江随即询问是哪三手，孙禄堂回答说：“无极式、三体式和劈拳。”张之江听后沉默，面露不满。之后，关于孙禄堂保守武术秘密的传言也开始流传。孙禄堂深知自己与张之江无法共事，因此决定辞去职务。虽然张之江多次挽留，并请李烈钧和李景林为他做说客，但孙禄堂的决定已然做出。最后，钮永建提出在江苏省成立国术馆，并表示对孙禄堂有更多的自主空间，这让孙禄堂最终答应了加入。

孙禄堂之所以拒绝南京国术馆，正是因为张之江所推崇的“无极式”、“三体式”和“劈拳”等招式过于侧重形式，缺乏实际战斗力，而南京国术馆的目标显然是培养具有实战能力的军官。根据资料，南京国术馆的术科内容包括形意拳、八卦拳、太极拳等传统武术，同时也涉及拳击、摔跤、长短兵等项目，其中摔跤和拳击的比例最大，这一设定是为了提升学员的实战能力。

南京国术馆的教学效果也证明了这一点。曾在南京国术馆接受过训练的张文广先生，后来成为新中国武术九段，并成为北京体育大学的创始人之一，他曾回忆起自己刚接触摔跤时，被摔得遍体鳞伤。显然，南京国术馆的教学风格追求的是实战经验，这与孙禄堂追求的传统套路教学形成了鲜明对比。最终，孙禄堂在南京仅待了短短几天，便转身去到镇江。

与此同时，江苏国术馆的教学则完全按照孙禄堂的方式进行，开设了三门课。尽管如此，江苏国术馆的学员在比赛中的成绩却惨不忍睹，直到孙禄堂1931年离开时，江苏国术馆的学员们依旧无法在比赛中获得好成绩。这与南京和湖南国术馆的实际战斗训练形成了鲜明对比。南京国术馆和湖南国术馆的学员，经过长时间的摔跤和拳击训练，展现出了超强的实战能力。

因此，尽管孙禄堂在民国时期享有极高的声誉，他的武术理论和教学方式仍然未能让他的学生取得实质性的成就。江苏国术馆的惨淡成绩，便是明证。这也导致了孙禄堂的影响力虽大，却难以让人完全服从。