在1946年6月7日，内战双方签署了《东北停战协议》。在军调部的监督下，尽管东北民主联军与杜聿明指挥的敌军之间仍有小规模冲突，但大规模军事行动已暂时停止。这一状态持续了近四个月。作为东北局的书记，林总敏锐地意识到，当前最重要的任务是巩固和整训部队。 林总与李天佑在东北民主联军总部（以下简称东总）承担着艰巨的任务。他们不仅需要进行政治动员和思想教育，更重要的是调整和统一全区的部队编制。由于之前的战斗不断，各部队的编制和番号不一致，导致东总指挥起来非常不便。例如，北满的主力部队由八路军山东第一师、第二师、新四军第三师及多个独立师、独立旅和警备旅组成。南满根据地也已组建了第3和第4纵队。如此混乱的编制状况，让任何司令部和总司令都会头痛不已。

因此，东北局与东总决定调整各二级军区和野战部队的编制，力求实现南满与北满部队编制的统一，为未来的战斗做准备。这个命令要求在三个月内完成调整。根据这一命令，四个二级军区——北满、西满、南满和东满——的军政领导和隶属关系重新进行了划分。最引人注目的是，野战部队的整编与新老部队的合并，北满主力开始组建野战纵队。 实际上，南满根据地早在1945年9月就已经组建了纵队编制。肖华领导的辽东军区就曾组建过野战纵队，其中的主体是从山东军区跨海到辽东的部队。到1946年初，南满根据地主力部队经过整合后，仍保留了两个纵队的编制——第3纵队和第4纵队。第3纵队于1946年1月正式组建，主要由八路军山东第3师、山东警备第3旅和冀热辽军区第16军分区的部队合编而成，初始兵力超过26000人。第4纵队则在1946年2月组建，基于八路军山东第5师、第6师及若干独立团，初始兵力约23000人。 因此，东北地区野战部队的整编和新老部队的合并，成为了军事发展的关键一步。在抗战时期，程世才为了保留南满原第3纵队、第4纵队的番号，将北满主力新组建的三个纵队依次命名为第1、第2和第6纵队。纵队下的编制统一为师，而南满的两个纵队的旅也统一改为师。第1纵队由山东第1师、第2师和山东滨海支队整编而成，司令员为万毅，副政委为周赤萍，兵力约26000人。第2纵队则由黄克诚的新四军第3师主力整编，司令员刘震，政委吴法宪，兵力约30000人。第6纵队则以新四军第3师第7旅和山东第7师为基础，司令员陈光，政委赖传珠，兵力约23000人。 随着南满根据地进入最困难时期，北满的三个主力纵队已正式成立。与此同时，南满的第3和第4纵队的实力大幅下降，总兵力仅剩30000人左右，每个师平均只有4000人左右。因此，北满决定调派3000名新兵来增强实力。到1946年10月，东北民主联军第一期整军完成，野战部队和地方部队的总兵力达到324000人，其中野战部队拥有五个纵队和三个独立师，总兵力超过120000人。除去独立师的兵力后，平均每个纵队兵力约为20000人。以这些初建兵力为基础，东北的纵队规模与陈粟的华东野战军和刘邓的晋冀鲁豫野战军相似，兵力从23000人到30000人不等，基本与敌方的一个军或整编师相当。东北我军最初组建的五个野战纵队，第1、第2、第3、第4、第6纵队，成为了未来东北野战军的骨干力量，被称为东北五虎，其作风优良，战斗力强大。 经过一系列战役的胜利，东北我军的士气得到了大幅提升，战场上缴获丰厚，而稳定的根据地也提供了大量新兵，野战部队的实力逐渐恢复并增强。北满主力包括三个野战纵队、六个独立师和两个保安旅，总兵力约为21万。此时，第1纵队、第2纵队和第6纵队的平均兵力达到34000人。南满主力则由两个野战纵队、三个独立师和一个支队组成，总兵力约8万人，其中第3纵队和第4纵队的兵力也恢复到30000人左右。经过整编，东北民主联军的兵力逐步扩充，发展到包括九个纵队和六个独立师的规模，实力进一步增强。 在东北解放战争初期，虽然各纵队的兵力差异较大，但随着时间的推移，部队的兵力逐渐提升。到1947年8月，东总的汇报显示，各纵队的兵力逐渐趋于平衡，但最大的一些师兵力可达11000人，最小的则为5000人。1948年春季，林总和刘首长计划完成11个纵队的编制，每个纵队的兵力目标达到35000人。随着战局的进展，军工生产能力的提升和二线兵团的组建，东北我军的整军条件已逐步成熟。1947年12月25日，东总正式公布了纵队和师的编制标准，并开始进行人员和装备的调整，标志着东北我军进入了大兵团、正规化、攻坚战的整军新阶段。 经过调整后，各纵队的平均兵力达到37000人，每个纵队拥有包括长枪、冲锋枪、机枪、炮兵等在内的各种武器装备。步兵师的编制为三个团，员额达到11221人。尽管这些数字仅为理论上的标准，但在实际战争中，各作战单位力求达到这些标准。 在1947年11月至1948年2月的冬季攻势中，东北我军取得了大胜，歼灭敌人超过15万人，部队士气大增，实力继续增强。此时，第三批野战纵队陆续组建，包括第5、第11和第12纵队，这三个纵队的初始兵力达到102000余人，虽然尚未达到满编，但整体实力已有显著提升。辽沈战役爆发前，东北野战军已经完成了对兵力和装备的全面统计，总兵力达到447800人。尽管战斗中各纵队的兵力有所变化，整体上兵力仍然保持稳定。 在辽沈战役中，东北野战军的主力纵队兵力大致为40000人，新建纵队的兵力为35000至37000人。在锦州战役和塔山阻击战期间，主力纵队如第1纵队和第4纵队的兵力也维持在40000人左右。无论是老纵队还是新纵队，兵力分布相对均衡，不会出现过大的差异。

辽沈战役后，虽然东北野战军损失了69213人，但在战后整补期间，野战部队不仅有伤愈归队的战士，还补充了大量解放战士，使得兵力更加充实。随着东野各纵队的调整，1948年11月入关时，纵队实现了四师制，这是与之前三三制的本质不同，为了尽量增加入关兵力，并便于部队管理。