秦始皇在世时，北方的蒙恬和蒙毅率领着三十万强大的骑兵部队驻守边境，防止匈奴的侵扰；而在南方，五十万步兵组成的主力军队则负责控制百越、交趾等地，并打通了西南夷的通道。然而，这样的安排导致了中原地区的军力相对不足。 秦帝国在消灭了东方六国之后，秦始皇目光转向了南方的百越地区，决定发动一场征战。这片土地通常被称为岭南，也就是现在的广东和广西。公元前219年，秦始皇派遣了五十万大军南下攻打百越，建立了强大的南方军团。那么，为什么在秦末的起义爆发时，北方的军团迅速做出反应，而南方的主力军却始终未曾动员呢？

首先，从陈胜吴广起义爆发到刘邦攻入咸阳，仅仅过了三年的时间。决定秦朝命运的关键是公元前208年的巨鹿之战，而这场战役发生时，仅距起义爆发已过两年。没有任何史料记录表明秦二世下令让赵陀率领岭南的秦军北上支援。即使在巨鹿战败后，秦二世急忙下令赵陀增援，但由于当时的交通条件，这一命令从咸阳传至广州，再从赵陀准备起军北上，至少需要两年的时间，而显然远远不够。 其次，秦二世胡亥是通过几个大臣的叛乱才登上帝位，这些核心人物对边疆将领的态度心中没有把握，甚至有些心虚。尤其对于长期镇守北方的长子，他们的心理防范尤为明显，几度对北方将领进行捕杀，这使得北方军心涣散，离心倾向加重。 第三，秦帝国从公元前219年起，开始了对南越地区的征服战争，直到公元前214年才基本平定南越。因此，在公元前208年时，南越尚未完全稳定，如果此时主力军调回北方，恐怕连南越的控制都难以保持。 第四，秦帝国的制度非常严格，一般人根本无法调动军队，尤其在皇帝被蒙蔽的情况下，其他叛乱的大臣更没有调动军队的权利。 第五，南方防越的部队主要由当地的核心将领掌控。赵佗在上司去世后，接管了权力，他选择不再干预中央事务，开始自立为王。很可能他已经意识到，中央一旦发生变故，局势会非常复杂。秦始皇去世后，中央权力真空，导致了军心的动荡和人心的分散。 还有一种分析认为，在帝国命运岌岌可危的时刻，南部军团的最高指挥官派人前往咸阳了解局势，结果得到的消息极其混乱。最终，他们在关键时刻选择了沉默。司马迁在《史记》中记载，当时的最高长官下令堵塞南北之间的所有通道，禁止南方军队北上作战。就这样，南方的秦军彻底抛弃了自己曾经建立的大帝国。与此同时，北方的三十万大军行动迟缓，负责保卫帝国心脏——咸阳的中卫军只有五万人。尽管陈胜和吴广带领几十万起义军进攻咸阳，遭遇了中卫军的顽强抵抗，但依然无法攻克。最终，章邯将军率领由20万修建秦始皇陵的刑囚组成的中部军团，彻底击败了起义军，秦帝国的命运似乎一度有了转机。 然而，起义的烈火已经蔓延到帝国的每个角落。原六国的旧贵族阶层不甘心退出历史舞台，随时准备借机起义。最后，秦军还是未能抵挡住项羽和刘邦的猛烈进攻，百万秦军最终消亡。 事实上，这支五十万的秦军，依旧是当时一支强大的武装力量。按照古代军队的作战水平，秦军无疑是无可匹敌的冠军，其作战能力甚至超过了汉朝军队和古罗马军队。从消灭敌人数量、攻城略地的能力来看，秦军的表现是独一无二的。

至于秦灭亡后，这五十万秦军的去向，至今仍是一个未解之谜。后世有不同的说法。有人认为，这支军队后来向南撤退，与南越民族融合；也有观点认为，他们投降了汉军。