《大明王朝1566》作为一部历史正剧，故事情节跌宕起伏，十分精彩，也深得观众的喜爱，这部电视剧的主要情节就是两党相争，线索就是在财政会议上严世藩提出来的改稻为桑的国策，而两党相争却早已有之。

嘉靖皇帝犹如一个导演，在幕后无形地操纵着一切，他的目的就是“鹬蚌相争渔翁得利”，他精心安排下的内阁运行的一个制度。他作为明朝奇葩皇帝之一，也有小癖好，那就是整天求仙问道，祈求长生不老。但是他也是个皇帝呀，不能置国家大事于不顾，也不能放弃他长生不老的痴心妄想，于是就想了个办法，寄希望于朝廷的内阁，以及自己的心腹机构司礼监，两个机构之间可以平衡关系，实现治国的目的，而嘉靖皇帝需要做的就是决策一下，甚至是有的事情，内阁就替他做了决定。

但是为了保证朝廷的平稳运行，内阁也需要相互制衡，那就有了严党和清流之间的争斗，二者都想置对方于死地，所以又有司礼监来平衡二者之间的争斗，起着和稀泥的作用。严党相当于贪官污吏，只为了自己的利益着想，但是有好处，那就是他们可以唯皇帝效忠，替皇帝搞到钱来修葺宫殿，维持宫内的开支，这容易联想到乾隆朝的和珅，深受乾隆的宠爱，虽然是贪官，但是也能提供给乾隆所需要的钱财。严嵩也是这个样子，八十岁的老人还担任着内阁首辅的职位，原因之一就是可以为嘉靖皇帝搞钱。

其次那就是他可以明确猜出嘉靖皇帝的心思，所以严党一心一意为皇帝服务，当然也有自己贪污的那个算盘。另一派当然是扮演者清官的角色，那就是清流，文官，以徐阶高拱和张居正为首，他们二人也担任着裕王的老师，清流们说自己是两袖清风，一心一意为百姓着想，其实他们唯一的目的就是斗翻严党，也没有顾上百姓的死活，在淳安建德两县的灾情就可以看出来，他们并没有在乎百姓的死活，只是想搞事情，事情搞大了，百姓受的灾越严重，他们越开心，因为这样离严党倒台就会更进一步。他们倒严的目的也并不是为了什么江山社稷，只是为了自己的仕途更进一步罢了。

而清流三人作为裕王的老师，自然也是希望裕王支持倒严，而裕王为了大明的江山社稷考虑，为了未来着想肯定也是想着打倒严嵩一派，那这就与清流不谋而合。而嘉靖在剧中只有裕王一个儿子，朱翊钧一个孙子，未来的大业肯定是要裕王来继承的，这一点精明的严嵩心里也是十分清楚，但是一朝天子一朝臣，嘉靖将他扶持上内阁首辅的位子上，自然目的就是他们要誓死效忠于嘉靖皇帝，这一点他们没有选择，甚至是没有退路，未来的下场他们不敢想，甚至严嵩早就预知到了自己的未来，但是他们也是别无退路，所有的希望都在嘉靖皇帝这里，嘉靖皇帝一旦挂掉，也是他严嵩垮台之日。而裕王在剧里是一个能急百姓之所急，忧百姓之所忧的人，所以他深知改稻为桑的国策行不通，才举荐海瑞和王用汲去担任淳安和建德的知县，他虽然也是想倒严，但是始终将百姓的安慰放在心上，裕王在剧中应该是一个很得民心的人。

这样裕王和清流和严党之间矛盾迭出，嘉靖的目的也就达到了。如果相反，严党如果突然倒向裕王一边，那么嘉靖皇帝不会让严嵩一派有好结果，因为自己制造的平衡一旦打破的话，民心就会倒向裕王那一边，那嘉靖的结果可能就是当太上皇了；或者即使嘉靖皇帝没有将严嵩怎么样，那么，裕王上台之后，严党依旧不会有好下场。这样的话，严党还不如死心塌地效忠于嘉靖皇帝，到嘉靖皇帝挂掉之后就听天由命了。

裕王想要千古流芳，留得一世英名的话，他也不可能会和大贪官结伙，首先他要稳住民心，其次要稳住清流，毕竟以后还需要他们的帮助，最重要的他还要保住自己贤君的名声。所以裕王不可能拉拢严党，而嘉靖还要利用严党打压裕王。