抗日战争初期，根据国共合作协议，我党部队进行了重大的调整和改编，红军三大主力部队被整编为八路军，而南方八省的游击队则被合并组建为新四军。八路军的正规编制是三个师、六个旅、十二个团，而新四军则是四个支队、八个团。从这一点可以清楚地看出，新四军的师在军衔和地位上与八路军平齐，而其支队则与八路军的旅平级。

皖南事变发生前，新四军的军事指挥体系已经初具规模。军级主官方面，军长由叶挺担任（飞机失事于1946年4月），副军长为项英（皖南事变中牺牲于1941年4月）。由于皖南事变的特殊情况，叶挺和项英未能获得正式授衔，但如果历史允许，两人应当拥有元帅的军衔。

在支队司令级，第一支队由陈毅担任司令员（元帅），副司令员是罗炳辉（1946年6月病逝）；第二支队的司令员是张鼎丞（后任最高人民检察院检察长），副司令员为粟裕（大将）；第三支队由张云逸担任司令员（元帅级大将），副司令员为谭震林（副总理）；第四支队司令员高敬亭（1939年6月被错杀），副司令员为戴季英（河南开封市委书记）。

在团级军事干部方面，第一团团长是傅秋涛（上将），副团长江渭清（江苏省委书记）；第二团团长张正坤（皖南事变牺牲），副团长刘培善（中将）；第三团团长黄火星（中将），副团长邱金生（皖南事变牺牲）；第四团团长卢胜（中将），副团长叶道志（错杀1938年9月）；第五团团长饶守坤（中将），副团长曾昭铭（牺牲1940年4月）；第六团团长叶飞（上将），副团长阮英平（遇害1948年2月）；第七团团长杨克志（叛变1939年5月），副团长曹玉福（叛变1939年5月）；第八团团长周骏鸣（水利部副部长），副团长林恺（体委副主任）。

此外，新四军还设有非正规团级干部。第九团团长顾士多（牺牲1939年1月），副团长高志荣（少将）；手枪团团长詹化雨（少将），副团长汪少川（少将）。值得注意的是，新四军组建初期，高敬亭指挥的安徽西部红28军将近5000人，仅获得第四支队第七团的编制，后来第四支队内部自行增设第九团与手枪团。第四支队第八团则由河南和湖北两省游击队合并而成。

皖南事变后，新四军进行了重组，军事主官也随之调整。军级干部方面，军长为陈毅（元帅），副军长为张云逸（元帅级大将）。师级军事干部中，第一师师长粟裕（大将），副师长叶飞（上将）；第二师师长张云逸（元帅级大将），副师长罗炳辉（1946年6月病逝）；第三师师长黄克诚（大将），副师长张爱萍（上将），其中黄克诚在1937年整编时职务为八路军115师344旅副旅长；第四师师长彭雪枫（牺牲1944年8月），副师长韦国清（上将）；第五师师长李先念（副总理）；第六师师长谭震林（副总理）；第七师师长张鼎丞（最高人民检察院检察长），副师长傅秋涛（上将）。

旅级军事干部方面，第一师下辖三旅：第1旅旅长叶飞（上将），第2旅旅长王必成（中将），第3旅旅长陶勇（中将）；第二师下辖第4旅梁从学（中将），第5旅成钧（中将），第6旅谭希林（中将）；第三师下辖第7旅彭明治（中将），第8旅田守尧（牺牲1944年3月），第9旅谭希林（中将）；第四师下辖第10旅刘震（上将），第11旅滕海清（中将），第12旅谭友林（少将），滕海清在1937年整编时职务为八路军129师385旅第770团第2营营长；第五师下辖第13旅周志坚（中将），第14旅罗厚福（大校），第15旅王海山（湖北省副省长）；第六师下辖第16旅罗忠毅（牺牲1941年11月），第17旅缺编，第18旅温玉成（中将）；第七师下辖第19旅孙仲德（安徽省副省长），第20旅梁金华（少将），第21旅马长炎（安徽省副省长）。 皖南事变后重组的新四军共有二十个旅长，只有叶飞与刘震被授予上将军衔，其余绝大多数旅长授予中将军衔。罗厚福因个人问题授衔大校，后来于1961年晋升为少将。这一系列调整不仅反映了新四军从游击队向正规军转型的过程，也展现了在战火纷飞中涌现出的卓越军事人才与不屈不挠的革命精神。